تأسس الاتحاد الملكي الاردني للرياضات البحرية في نهاية الستينات وهو الآن احد الاتحادات الرياضية الرسمية التابعة الى اللجنة الاولمبية الاردنية بموجب نظام الاتحادات الرياضية الاردنية رقم (73) لسنة 2021 و الصادر بمقتضى الفقرة (ب) من المادة (9) من قانون اللجنة الاولمبية الاردنية رقم ( 13 ) لسنة 2007م. وهو الاتحاد الرياضي الوحيد الذي مقره خارج العاصمة عمان و يقع في مدينة العقبة حيث ان رياضات الاتحاد هي بحرية في الدرجة الاولى وهذا هو السبب الذي اوجد مقر الاتحاد في مدينة العقبة الساحلية للممارسة هذه الرياضات البحرية.
ويدير الاتحاد الملكي الاردني للرياضات البحرية مجلس ادارة مكون من سبعة اعضاء (4) منهم ينتخبون من خلال الهيئة العامة المؤسسة للاتحاد من روابط الاندية والمراكز الرياضية المنتسبة للاتحاد واللاعبون المتعزلون و (3) اعضاء من فئة المعينين حيث أن المدة القانونية لمجلس الادارة هي اربع سنوات ثم يحل المجلس بعد نهاية كل دورة اولمبية ويحكم عمل المجلس نظام الاتحادت الرياضية الاردنية اعلاه .
هذا وينبثق عن الاتحاد من خلال مجلس الادارة اللجان المختلفة لتفعيل عمل الاتحاد ومنها لجنة المنتخبات واللجنة الفنية و اللجان الاخرى المساعدة مثل لجان التدريب و المدربين و لجنة الحكام المركزية وكل واحدة منها لها وصف العمل الخاص بها .
كما ينظم عمل الاتحاد جهازين فني و اداري ، اما الجهاز الفني للاتحاد فيتالف من السكرتير التنفيذي و المحاسب و مدقق اللوازم و اصحاب المهن الادارية و الخدماتية و الاخرى ذات العلاقة ، واما الاجهاز الفني للاتحاد فيتالف من الاجهزة التدريبية بمن في ذلك المديرون الفنيون و المدربون و مساعدو المدربين و الاطباء و فنيو العلاج و اداريو المنتخبات و المهن الاخرى ذات العلاقة و الحكام.